R scripts

Category
Herramientas estadísticas
Usability
Difficult to use
Platform
Mac
Windows
Linux
Version
Version 0.9
Developers
Fred van Eeuwijk
Marcos Malosetti
Lucia Gutierrez (Biometris, Wageningen University, Netherlands)

Nota: Descargar de esta herramienta está suspendido en espera de la liberación de una versión mejorada.

R es un lenguaje libremente disponible y un ambiente para el cálculo estadístico y gráficos que proporciona una amplia variedad de técnicas estadísticas y gráficas: modelos lineales y no lineales, pruebas estadísticas, análisis de series temporales, clasificación, agrupación, etc. El uso de scipts en R requiere la instalación de CRAN y el conocimiento del   lenguaje de la línea de comandos.

Una serie de scripts R en han sido creados por los desarrolladores de Mejoramiento Integrado (MI)  para modernizar los análisis de los experimentos tipicos en el mejoramiento de cultivos, incluyendo análisis fenotípicos y el mapeo de QTLs. Los dos principales tipos de analisis fenotiípicos son posibles: a) análsis de un solo ensayo usando datos crudos (datos del ensayo), y b) análisis multiambientes o análisis GxE, basados en el análisis de un solo ensayo para diferentes ambientes. Con respecto a la detección de QTLs, el usuario puede conducir el análsis por mapeo por intervalo simple (Simple Interval Mapping, SIM)  y mapeo por intervalo compuesto (Composite Interval Mapping, CIM). La versión actual unicamente soporta el mapeo de QTL en un solo ambiente

Estas herramientas serán eventualmente integradas en un software con una  interfaz gráfica de usuario.

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